BLAST è un algoritmo informatico disponibile per l'uso online sul sito web del National Center for Biotechnology Information (NCBI), così come in molti altri siti. BLAST può allineare e confrontare rapidamente una sequenza di DNA di query con un database di sequenze, il che lo rende uno strumento fondamentale nella ricerca genomica in corso.
BLAST è un database primario?
BLAST è il software più utilizzato nella ricerca bioinformatica. La sua funzione principale è confrontare una sequenza di interesse, la sequenza di query, con le sequenze in un grande database BLAST, quindi riporta le migliori corrispondenze, o "risultati", trovati nel database. Questo semplice programma ha due applicazioni principali.
NCBI è un database?
L'NCBI ospita una serie di database rilevanti per la biotecnologia e la biomedicina ed è una risorsa importante per strumenti e servizi di bioinformatica. I principali database includono GenBank per le sequenze di DNA e PubMed, un database bibliografico per la letteratura biomedica. Altri database includono il database Epigenomics NCBI.
BLAST è impiegato solo nei database NCBI?
BLAST è disponibile sul web sul sito web dell'NCBI. Sono disponibili diversi tipi di BLAST in base alle sequenze di query e ai database di destinazione.
Come funziona il database BLAST?
Come funziona BLAST? BLAST identifica sequenze omologhe usando un metodo euristico che inizialmente trova brevi corrispondenze tra due sequenze; quindi, il metodo non tiene conto dell'intero spazio della sequenza. Dopo la partita iniziale, BLAST tenta di avviare gli allineamenti locali da queste partite iniziali.
