Sommario:
- Cos'è il formato bigWig?
- Come si usa il file bigWig?
- Cos'è una traccia bigWig?
- Come faccio a creare un file bigWig?
Video: Cos'è il file Bigwig?
2024 Autore: Fiona Howard | [email protected]. Ultima modifica: 2024-01-10 06:39
BigWig è un formato di file per la visualizzazione di dati densi e continui in una traccia del browser del genoma, creato dalla conversione dal formato Wiggle (WIG). Il formato BigWig è descritto nel sito Web della UCSC Genome Bioinformatics e la guida al formato dei file del Broad Institute fornisce ulteriori informazioni.
Cos'è il formato bigWig?
Il formato bigWig è per la visualizzazione di dati densi e continui che verranno visualizzati come un grafico I file BigWig vengono creati inizialmente da file di tipo WIG, utilizzando il programma UCSC wigToBigWig. In alternativa, i file bigWig possono essere creati dai file bedGraph, utilizzando il programma UCSC bedGraphToBigWig.
Come si usa il file bigWig?
Sposta il file bigWig appena creato (myBigWig.bw) in una posizione accessibile dal Web http, https o FTP. Incolla l'URL nel modulo di immissione della traccia personalizzata o costruisci una traccia personalizzata utilizzando una singola riga di traccia. Incolla la riga della traccia personalizzata nella casella di testo nella pagina di gestione della traccia personalizzata.
Cos'è una traccia bigWig?
bigWig Tracks sono tracce per segnali continui attraverso l'intero genoma. Sono adatti per visualizzare vari risultati di esperimenti "grezzi" come segnali ChIP-Seq, segnali RNA-Seq, ecc.
Come faccio a creare un file bigWig?
Ci sono diversi modi per generare file bigwig. Questo di solito comporta la conversione di un file. bam in una traccia wiggle (. wig) e quindi convertire la traccia wiggle in una bigwig binaria (.
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