La metagenomica è definita come l'analisi genetica diretta dei genomi contenuti in un campione ambientale Il campo è iniziato inizialmente con la clonazione del DNA ambientale, seguita dallo screening dell'espressione funzionale [1], ed è stato quindi rapidamente integrato dal sequenziamento casuale diretto del DNA ambientale [2, 3].
Qual è il processo della metagenomica?
Metagenomica implica l'ottenimento di DNA da tutti i microrganismi all'interno di una comunità, senza necessariamente identificare tutte le specie coinvolte. Dopo che i geni sono stati sequenziati e confrontati con le sequenze identificate, è possibile determinare le funzioni di questi geni.
Quale tecnica viene utilizzata nella metagenomica?
Un campione della comunità microbica viene raccolto da acqua di mare, sedimenti, animali ospiti o altri habitat marini. Le cellule raccolte vengono quindi lisate e il DNA viene estratto dal loro lisato. La tecnica che rende possibile la metagenomica è shotgun sequencing, che sequenzia le regioni casuali del DNA in modo non mirato.
Quali sono i 3 passaggi per lo studio della metagenomica?
Passi e processo della metagenomica:
- Raccolta di campioni:
- Estrazione del DNA:
- Preparazione del campione:
- Analisi del campione:
Come viene eseguita la metagenomica funzionale?
La metagenomica funzionale implica isolare il DNA dalle comunità microbiche per studiare le funzioni delle proteine codificate. Implica la clonazione di frammenti di DNA, l'espressione di geni in un ospite surrogato e lo screening delle attività enzimatiche.
