Come selezionare gli atomi in pymol?

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Come selezionare gli atomi in pymol?
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Video: Come selezionare gli atomi in pymol?

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Video: Tutorial PyMOL: Come misurare le distanze tra atomi (ITA) 2024, Novembre
Anonim

Quando clic con il tasto sinistro e rilasci su un atomo usando il pulsante sinistro, PyMOL dovrebbe, per impostazione predefinita, selezionare l'intero residuo: questo creerà una voce (sele)” nel pannello di controllo su cui è possibile agire utilizzando i menu a comparsa.

Come selezioni le cose in PyMOL?

seleziona

  1. Utilizzo. seleziona nome, selezione [, abilita [, silenzioso [, unisci [, stato [, dominio]
  2. Argomenti. nome=un nome univoco per la selezione. …
  3. Esempi. select chA, chain A select (resn his) select near142, resi 142 around 5.
  4. Note. …
  5. Vedi anche. …
  6. Più.

Come selezioni i titoli in PyMOL?

Puoi creare facilmente un nuovo legame selezionando due atomi, ciascuno con il CTRL-PULSANTE-CENTRALE-MOUSE e digitando "bond" sulla riga di comando.

Come si seleziona un amminoacido specifico in PyMOL?

– sotto il menu “display” selezionare “sequence on”. Apparirà una barra sopra la struttura che mostra la sequenza amminoacidica di tutte le catene proteiche nella finestra. Usa l'opzione-maiusc per selezionare tutti gli aa per una catena.

Come si seleziona una sequenza in PyMOL?

Risposta più recente

  1. Carica la tua struttura proteica in pymol.
  2. Fare clic sul pulsante 'S' per caricare la sequenza della sequenza di amminoacidi.
  3. Trova la sequenza di amminoacidi che desideri visualizzare e selezionala.
  4. puoi cambiarne il colore o la modalità di aspetto (come cartoni animati, sfere, nastri, bastoncini, superficie ecc.)

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Perché gli atomi hanno risonanze?

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Le strutture di Lewis equivalenti sono chiamate forme di risonanza. Sono usati quando c'è più di un modo per posizionare doppi legami e coppie solitarie sugli atomi. Le strutture di risonanza sorgono quando ci sono più modi per disegnare un diagramma a punti di Lewis che soddisfi la regola dell'ottetto .

Gli atomi sono per lo più spazio vuoto?

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Gli atomi non sono per lo più spazi vuoti perché non esiste uno spazio puramente vuoto Piuttosto, lo spazio è riempito con un'ampia varietà di particelle e campi. … È vero che una grande percentuale della massa dell'atomo è concentrata nel suo minuscolo nucleo, ma ciò non implica che il resto dell'atomo sia vuoto .

Come Democrito scoprì gli atomi?

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Da cui provengono gli atomi?

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Gli atomi sono stati creati dopo il Big Bang 13,7 miliardi di anni fa. Quando il nuovo universo caldo e denso si raffreddò, le condizioni divennero adatte alla formazione di quark ed elettroni. I quark si unirono per formare protoni e neutroni e queste particelle si combinarono in nuclei .

Cosa sono gli atomi donatori?

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L'atomo donatore è l'atomo all'interno del ligando che è attaccato al centro dell'acido di Lewis. Il numero di coordinazione è il numero di atomi donatori nel complesso di coordinazione. La denticità di un ligando è il numero di legami che forma con il centro dell'acido di Lewis .